ETF与普通的指数基金存在较大的区别，由于其可在二级市场进行交易且跟踪紧密，其在套利方面的作用更大。首先，ETF一、二级市场价格存在不对等的情况，这样就存在瞬时套利机会与事件套利机会；其次，由于ETF二级市场价格与目标指数并不会完全一致，因此会存在期现套利机会。
1、瞬时套利交易
由于嘉实沪深300ETF交易结算需要T+2，其与华泰柏瑞沪深300ETF在瞬时套利方面存在不同的操作要求。
华泰柏瑞沪深300ETF瞬时套利流程
当ETF价格大于实时净值时，按照申赎清单买入一揽子股票，将其提交到一级市场以进行ETF申购交易，在获得ETF份额之后直接在二级市场上进行卖出以获得套收益。反之，则在二级市场上买入ETF并申请赎回，再将赎回的股票在二级市场上卖出。
嘉实沪深300ETF瞬时套利流程
由于嘉实沪深300ETF申购或赎回指令T+1日得到确认，在T+2日才能获得申购份额或者赎回证券，所以无法像华泰柏瑞沪深300ETF那样实现一、二级市场的日内交易，但是其或可通过融券机制实现瞬时套利，即当沪深300ETF溢价时，除了买入成分股之外，还需要同步卖出ETF份额，待T+2日获得申购的ETF份额时在归还融入的ETF份额。反之则需要融券卖出成分股并同时买入ETF份额，同日申请进行买入ETF份额的赎回，待到T+2日获得成分股之后再归还融入的成分股。
瞬时套利涉及的成本主要包括
ETF申购/赎回费用、经手费、过户费、证管费、证券结算金(总共约0.03%)；印花税(0.1%)；ETF二级市场交易佣金、股票交易佣金(均约为0.05%)；市场冲击成本(一般为0.1%)。因此，溢价套利成本约为0.33%，而折价套利成本约为0.23%。当然是用嘉实沪深300ETF进行瞬时套利还涉及融券成本，这项成本影响是非常大的。
2、事件套利交易
多头套利预计某只停牌的成分股A复牌后会大涨或者已经涨停无法买入某只成分股，在这种情况下，若使用华泰柏瑞沪深300ETF，只需要在二级市场上买入ETF，同时申请赎回以取得相应的股票，卖出除A以外的其他股票，以间接的方式获得无法买入的成分股。如果使用嘉实沪深300ETF进行套利操作，则需要在T时融券卖出除A以外的其他成分股，在T+2日归还。
空头套利预计某只停牌额成分股A复牌后会大跌或者已经跌停无法卖出，在这种情况下，若使用华泰柏瑞沪深300ETF，只需要在二级市场上买入ETF中除A之外的其他成分股，同时用现金替代A进行ETF的申购，之后再二级市场上卖出ETF，以间接的方式进行股票的卖空操作。如果使用嘉实沪深300ETF进行套利操作，则需要在T时融券卖出ETF，在T+2日归还。